La Unión Regional de Jóvenes Bautistas de la Segunda Región de Antofagasta, es una entidad fraternal, constituida por las organizaciones juveniles de la zona, que presenten su interés de afiliación, siendo un prerrequisito que las congregaciones que la representan formen parte activa de la Unión de Iglesias Bautistas de la Segunda Región, y a su vez a la Unión de Iglesias Evangélica Bautista de Chile o a la entidad que la reemplace, las que se identifican, vinculan y comparten entre sí la misma doctrina Bautista. La URJB Antofagasta está organizada en dos sectores: Sector Costa (Provincias de Antofagasta y Tocopilla) y Sector Loa (Provincia El Loa). Todas las organizaciones debidamente afiliadas formaran a su vez parte de la Unión Nacional de Jóvenes Bautistas de acuerdo al protocolo administrativo correspondiente.